微生物有機(jī)肥就是指具有營養(yǎng)功能（間接或直接）成分的組合，這種微生物施入土壤后能存活、迅速繁殖和發(fā)揮功能，實(shí)際上就是功能微生物和適合于這種微生物生長的有機(jī)載體的集合。

從這種意義上講，堆肥并不等于微生物有機(jī)肥料，微生物有機(jī)肥料更不要與生物肥料混淆。過去講的生物肥料實(shí)際上是微生物菌劑。由于沒有有采購載體，不能確保微生物施到土壤后能存活和繁殖。微生物肥料有固氮、解磷、解鉀、頡頏病原、低濕促生微生物有機(jī)肥料等種類。這些作用與中國化肥投入減氮、活磷、補(bǔ)鉀的政策一致。

目前微生物有機(jī)肥料的研制思路分兩條主線：一是篩選特定微生物，然后選擇合適的液體發(fā)酵條件；二是根據(jù)堆肥、氨基酸肥不同，配伍不同的有機(jī)載體，然后進(jìn)行微生物有機(jī)肥料產(chǎn)品的開發(fā)研制。