1 種子形狀
紫苜蓿種子腎臟形或?qū)挋E圓形，兩側(cè)扁、不平、有角棱，正視腹面對兩側(cè)呈波浪狀，種子稍彎曲或扭曲；白花草木樨種子倒卵形成腎狀橢圓形，在寬端有時多少呈截形，一側(cè)扁平，另一側(cè)圓，黃花草木樨種子倒卵狀橢圓形，常一側(cè)扁平，另一側(cè)稍圓。
2 種子大小
紫苜蓿種子長約2～3毫米，寬約1．20～1．80毫米，厚約0．70～1．10毫米。胚根長為子葉長的1／2或略短。白花草木樨種子長1．50～2．50毫米，寬1．30～1．70毫米，厚0．80～1．20毫米。黃花草木樨種子長約2毫米，寬1．50毫米，厚1毫米。白花草木樨和黃花草木樨種子的胚根長為子葉長的2／3～3／4或更長。
3 種子顏色
紫苜蓿種子表面黃色到淺褐色，有光澤；白花草木樨種子表面黃色、紅黃色或黃褐色，無光澤。黃花草木樨種子表面黃色，黃綠色或淺褐色，具紫色點狀花斑或無，不具花斑者與白花草木樨種子較難區(qū)別，無光澤或稍有光澤。
4 種臍
紫苜蓿種子的種臍近種子長的中央，圓形，直徑約0．18毫米，白色，凹陷。種瘤在種臍下邊，突出，褐色，距種臍0．20～0．30毫米。有胚乳。白花草木樨種子的種臍在種子長的1／2以下，圓形，直徑0．13毫米，白色，凹陷。臍周圍有一圈不明顯的褐色小瘤，距種臍0．50毫米，胚乳披薄。黃花草木樨種子的種臍也在種子長的1／2以下，圓形，直徑0．17毫米，褐色或白色。種瘤在種子基部，突出、褐色，距種臍0．50毫米有胚乳。