基因一詞是由“GENE”音譯而來(lái)，廣義上是指核酸，它是生命遺傳的基本物質(zhì)。核酸分脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)兩類(lèi)，具體地講，絕大多數(shù)遺傳物質(zhì)是DNA，個(gè)別生物的遺傳物質(zhì)是RNA，如RNA病毒�；蚴蔷哂羞z傳效應(yīng)的DNA片段，它存在于染色體上，并在染色體上呈線性排列。不同基因具有相同的物質(zhì)基礎(chǔ)，而所有生物DNA的基本結(jié)構(gòu)都是一樣的。地球上一切生物的基因，都是具有遺傳功能的特定核苷酸序列的DNA片段。
細(xì)胞或生物體的全部染色體的總和稱(chēng)為基因組，包括全部的基因與調(diào)控元件等核酸分子。生物進(jìn)化高低程度決定基因組的大小、含量及其復(fù)雜性。不同生物基因組的親緣相關(guān)性，表現(xiàn)為基因特性、結(jié)構(gòu)及組成的相似性，或遺傳信息的傳遞方式及遺傳密碼的趨同性等。
生物分類(lèi)是指將生物依據(jù)種源關(guān)系加以區(qū)分排列，以使具有共同祖先的個(gè)體(或種群)排在一起。目前廣泛使用的生物分類(lèi)學(xué)仍沿用以形態(tài)、性狀為主的分類(lèi)方法。較新DNA分析研究表明其中存在著明顯的錯(cuò)誤。分類(lèi)學(xué)家利用基因分析技術(shù)對(duì)一些動(dòng)植物進(jìn)行了綜合分析，以基因相似程度區(qū)分物種之間的親緣關(guān)系，結(jié)果得出一些與傳統(tǒng)分類(lèi)學(xué)相悖的結(jié)論。傳統(tǒng)分類(lèi)學(xué)過(guò)多依賴(lài)于生物的外在因素，是在人類(lèi)無(wú)法了解生物遺傳本質(zhì)的情況下問(wèn)世的，因而不能完善地反映真實(shí)情況。利用基因作為生物分類(lèi)的基礎(chǔ)，要比傳統(tǒng)分類(lèi)法更科學(xué)、更準(zhǔn)確。
隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展，在生物體內(nèi)識(shí)別單個(gè)基因以及比較不同物種之間基因的相似性已經(jīng)成為可能�，F(xiàn)在科學(xué)家已經(jīng)完成了用基因法為植物進(jìn)行分類(lèi)的工作。依據(jù)較新報(bào)道，如傳統(tǒng)分類(lèi)學(xué)(柯朗奎斯特系統(tǒng)，1981年)分別歸入小二仙草目小二仙草科的植物與薔薇目虎耳草科的扯根草屬搐物，兩者之間的DNA序列極為相似，毫無(wú)疑問(wèn)兩者之間存在極近的親緣關(guān)系；再如，大